MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_015942	ACT	2	6	308175	308180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198523
6003	NC_015942	GCC	2	6	308304	308309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198523
6004	NC_015942	GTG	2	6	308330	308335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6005	NC_015942	GTG	2	6	308353	308358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198523
6006	NC_015942	GC	3	6	308408	308413	0 %	0 %	50 %	50 %	344198523
6007	NC_015942	CTG	2	6	308543	308548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6008	NC_015942	CAG	2	6	308566	308571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6009	NC_015942	A	7	7	308603	308609	100 %	0 %	0 %	0 %	344198524
6010	NC_015942	TCT	2	6	308646	308651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198524
6011	NC_015942	CCG	2	6	308696	308701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198524
6012	NC_015942	CTG	2	6	308722	308727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6013	NC_015942	GGC	2	6	308748	308753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198524
6014	NC_015942	GCT	2	6	308772	308777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6015	NC_015942	CG	3	6	308869	308874	0 %	0 %	50 %	50 %	344198524
6016	NC_015942	TGC	2	6	308912	308917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6017	NC_015942	TGG	3	9	309047	309055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198524
6018	NC_015942	GCC	2	6	309103	309108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198524
6019	NC_015942	GTC	2	6	309137	309142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6020	NC_015942	GCC	2	6	309169	309174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198524
6021	NC_015942	CGC	2	6	309272	309277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198524
6022	NC_015942	CTG	2	6	309307	309312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198524
6023	NC_015942	TC	3	6	309363	309368	0 %	50 %	0 %	50 %	344198524
6024	NC_015942	CAC	2	6	309369	309374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198524
6025	NC_015942	CG	3	6	309434	309439	0 %	0 %	50 %	50 %	344198524
6026	NC_015942	T	6	6	309574	309579	0 %	100 %	0 %	0 %	344198525
6027	NC_015942	CAC	3	9	309589	309597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198525
6028	NC_015942	GCAG	2	8	309647	309654	25 %	0 %	50 %	25 %	344198525
6029	NC_015942	CTG	2	6	309709	309714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6030	NC_015942	GAT	2	6	309715	309720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198525
6031	NC_015942	GCC	2	6	309749	309754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198525
6032	NC_015942	ACC	2	6	309770	309775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198525
6033	NC_015942	CCG	2	6	309945	309950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198525
6034	NC_015942	GGA	2	6	309960	309965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198525
6035	NC_015942	TTG	2	6	310040	310045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198525
6036	NC_015942	TGCC	2	8	310077	310084	0 %	25 %	25 %	50 %	344198525
6037	NC_015942	GGC	2	6	310087	310092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198525
6038	NC_015942	CGA	2	6	310116	310121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6039	NC_015942	GCG	2	6	310164	310169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198525
6040	NC_015942	CAC	2	6	310234	310239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198525
6041	NC_015942	GCC	2	6	310285	310290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198525
6042	NC_015942	ACC	2	6	310322	310327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198525
6043	NC_015942	GCGG	2	8	310419	310426	0 %	0 %	75 %	25 %	344198525
6044	NC_015942	GC	3	6	310476	310481	0 %	0 %	50 %	50 %	344198525
6045	NC_015942	AGC	2	6	310565	310570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198525
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6048	NC_015942	ACG	2	6	310661	310666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6049	NC_015942	TGA	3	9	310698	310706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198525
6050	NC_015942	T	6	6	310728	310733	0 %	100 %	0 %	0 %	344198525
6051	NC_015942	TGC	2	6	310736	310741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6052	NC_015942	TGA	2	6	310778	310783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198525
6053	NC_015942	A	6	6	310783	310788	100 %	0 %	0 %	0 %	344198525
6054	NC_015942	CTG	2	6	310825	310830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6055	NC_015942	GTG	2	6	310847	310852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198525
6056	NC_015942	CTG	2	6	310853	310858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198525
6057	NC_015942	TTG	2	6	310924	310929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198525
6058	NC_015942	TCG	2	6	310941	310946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198525
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6061	NC_015942	ACT	2	6	311039	311044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198525
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6063	NC_015942	TGC	2	6	311494	311499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198526
6064	NC_015942	CAG	2	6	311519	311524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198526
6065	NC_015942	CTGGGC	2	12	311582	311593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198526
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6067	NC_015942	CTG	2	6	311609	311614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198526
6068	NC_015942	GTC	2	6	311744	311749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198526
6069	NC_015942	TGA	2	6	311773	311778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198526
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6071	NC_015942	CGA	2	6	311821	311826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198526
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6073	NC_015942	GGACC	2	10	311959	311968	20 %	0 %	40 %	40 %	344198526
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6080	NC_015942	CGG	2	6	312420	312425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198527
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6088	NC_015942	GGC	3	9	312635	312643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198527
6089	NC_015942	GCG	2	6	312664	312669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198527
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6105	NC_015942	GA	3	6	313170	313175	50 %	0 %	50 %	0 %	344198528
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6108	NC_015942	A	6	6	313262	313267	100 %	0 %	0 %	0 %	344198528
6109	NC_015942	CG	3	6	313272	313277	0 %	0 %	50 %	50 %	344198528
6110	NC_015942	GCC	2	6	313358	313363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198528
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6112	NC_015942	TGG	2	6	313507	313512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198528
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6119	NC_015942	GCTG	2	8	313828	313835	0 %	25 %	50 %	25 %	344198528
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6121	NC_015942	TTC	2	6	313922	313927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198528
6122	NC_015942	CCG	2	6	313953	313958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198528
6123	NC_015942	CCA	2	6	313984	313989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198528
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6134	NC_015942	GC	3	6	314402	314407	0 %	0 %	50 %	50 %	344198528
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6142	NC_015942	CGG	2	6	314821	314826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
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6145	NC_015942	GC	3	6	315012	315017	0 %	0 %	50 %	50 %	344198528
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6151	NC_015942	GC	3	6	315268	315273	0 %	0 %	50 %	50 %	344198528
6152	NC_015942	GCA	2	6	315275	315280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198528
6153	NC_015942	GAAA	2	8	315441	315448	75 %	0 %	25 %	0 %	344198528
6154	NC_015942	GCG	2	6	315482	315487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198528
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6183	NC_015942	GCC	2	6	316904	316909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198530
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6185	NC_015942	TGC	2	6	316977	316982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198530
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6204	NC_015942	CGCC	2	8	317809	317816	0 %	0 %	25 %	75 %	344198530
6205	NC_015942	GATC	2	8	317830	317837	25 %	25 %	25 %	25 %	344198530
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6211	NC_015942	GATCG	2	10	318294	318303	20 %	20 %	40 %	20 %	344198531
6212	NC_015942	CAC	2	6	318319	318324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198531
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6214	NC_015942	TGCCGG	2	12	318507	318518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198531
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6217	NC_015942	GC	4	8	318667	318674	0 %	0 %	50 %	50 %	344198531
6218	NC_015942	ACC	2	6	318722	318727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198531
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6220	NC_015942	TGA	2	6	318783	318788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198531
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6222	NC_015942	CTA	2	6	319029	319034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198531
6223	NC_015942	CCT	2	6	319035	319040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198531
6224	NC_015942	TCG	2	6	319042	319047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198531
6225	NC_015942	TGC	2	6	319074	319079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198531
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6229	NC_015942	AGAT	2	8	319262	319269	50 %	25 %	25 %	0 %	344198531
6230	NC_015942	GGGAC	2	10	319279	319288	20 %	0 %	60 %	20 %	344198531
6231	NC_015942	AAG	2	6	319295	319300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198531
6232	NC_015942	AAG	2	6	319386	319391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198532
6233	NC_015942	ATT	2	6	319403	319408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198532
6234	NC_015942	ACTGG	2	10	319432	319441	20 %	20 %	40 %	20 %	344198532
6235	NC_015942	GAA	2	6	319442	319447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198532
6236	NC_015942	TGC	2	6	319491	319496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198532
6237	NC_015942	GTT	2	6	319639	319644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198532
6238	NC_015942	GCG	2	6	319710	319715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198532
6239	NC_015942	CGAT	2	8	319737	319744	25 %	25 %	25 %	25 %	344198532
6240	NC_015942	TAT	2	6	319767	319772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344198532
6241	NC_015942	GGC	2	6	319843	319848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198532
6242	NC_015942	TTGA	2	8	319865	319872	25 %	50 %	25 %	0 %	344198532
6243	NC_015942	CAAT	2	8	320030	320037	50 %	25 %	0 %	25 %	344198533
6244	NC_015942	TAA	2	6	320038	320043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198533
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6250	NC_015942	CTG	2	6	320318	320323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198533
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6255	NC_015942	CGCC	2	8	320657	320664	0 %	0 %	25 %	75 %	344198534
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6359	NC_015942	GC	3	6	325585	325590	0 %	0 %	50 %	50 %	344198537
6360	NC_015942	CTGG	2	8	325671	325678	0 %	25 %	50 %	25 %	344198537
6361	NC_015942	GC	3	6	325706	325711	0 %	0 %	50 %	50 %	344198537
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6363	NC_015942	CGA	2	6	325767	325772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198537
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6365	NC_015942	GGC	2	6	325802	325807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198537
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6367	NC_015942	ATC	2	6	325868	325873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198537
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6473	NC_015942	ACC	2	6	330611	330616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198541
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6484	NC_015942	GAA	2	6	331101	331106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198541
6485	NC_015942	TCG	2	6	331180	331185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6486	NC_015942	AGC	2	6	331189	331194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6487	NC_015942	GGC	2	6	331266	331271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198541
6488	NC_015942	CTG	2	6	331335	331340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6489	NC_015942	GC	5	10	331359	331368	0 %	0 %	50 %	50 %	344198541
6490	NC_015942	CCG	2	6	331375	331380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198541
6491	NC_015942	CG	4	8	331424	331431	0 %	0 %	50 %	50 %	344198541
6492	NC_015942	AGC	2	6	331444	331449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6493	NC_015942	GATGG	2	10	331458	331467	20 %	20 %	60 %	0 %	344198541
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6495	NC_015942	ACCAG	2	10	331667	331676	40 %	0 %	20 %	40 %	344198541
6496	NC_015942	TCC	2	6	331726	331731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198541
6497	NC_015942	CGA	2	6	331759	331764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6498	NC_015942	CAG	2	6	331818	331823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6499	NC_015942	AGC	2	6	331879	331884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198541
6500	NC_015942	CA	3	6	331950	331955	50 %	0 %	0 %	50 %	344198541

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